明代是大觉寺历史上的鼎盛时期，据寺存明代各朝碑文记载，从宣德三年（1428年）至成化十四年（1478年）整整半个世纪的时间里，明皇室对大觉寺进行了三次较大规模的重修和扩建，现存寺院建筑和规模基本是明代奠定的。明代的宣宗、英宗、宪宗、孝宗皇帝曾多次临幸驻跸大觉寺，帝王们不仅出资重修寺庙、遣僧住持而且还赏赐田亩、颁赐藏经，使得大觉寺不仅殿堂巍峨，佛像庄严，僧弥众多，而且寺庙经济相当发达，成为西山三百寺中的一座巨刹。

　　明英宗正统十年（1445年）二月，朝廷曾颁赐《大藏经》一部于大觉寺永充供养。《大藏经》是汇集佛教全部经典的一部全书。主要内容由经、律、论三部分组成，又称《三藏经》。宋太祖开宝四年刻《大藏经》5000余卷，是第一次大规模的刻经工作，从宋太祖时开始，经元、明、清各代，朝野所刻大藏经有许多种,而官版《大藏经》主要是颁赐给国内名山大寺和赠送友邦邻国的，因此大都刻工精良，装帧华美。《永乐北藏》开雕于永乐十九年（1421年）完成于正统五年（1440年），为折装本，字体秀丽，用于颁赐天下名山寺院，目前传世本相当罕见。大觉寺当时能得到明英宗所赐《大藏经》足以证明其当时的佛教地位之高和与明皇室的关系之密切。明正统十年颁大藏经敕谕碑位于寺内无量寿佛殿北侧前，碑身宽0.70米，高2.35米。螭首龟趺，汉白玉石质，明正统十年刻，英宗朱祁镇撰文。

　　皇帝圣旨：朕体天地保民之心，恭成皇曾祖考之志，刊印大藏经典，颁赐天下用广流传。兹以一藏安置大觉寺，永充供养，听所在僧官僧徒看诵赞扬，上为国家祝釐，下与生民祈福。务须敬奉守护，不许纵容闲杂之人私借观玩，轻慢亵渎，致有损坏遗失，敢有违者，必究治之。谕。正统十年二月十五日。

　　大觉寺内无量寿佛殿西侧墙壁前还立有六组高大的木质经橱，由于年代久远，外观已呈黑色。经橱高2.86米，宽2 米，厚0.95米，门对开两扇，里面是分隔成数层的木屉，曾经收藏《永乐北藏》。将内容丰富，数量庞大的经卷收藏分类是件非常不容易的事情。

　　如今寺藏文物中还有部分残卷，为明代藏经遗存。